Inicios
El arquero nació el 30 de junio de 1983 en Lugano, provincia de Buenos Aires, Argentina. De muy chico jugaba al baby fútbol en Huracán, luego pasó al club Buenos Aires Sur de Boedo al mismo tiempo que comenzaba a jugar en cancha de 11 con el Globo. Hizo todas las divisiones en el club de Parque Patricios hasta su debut en Primera División.
Debut como profesional
Su debut como arquero profesional fue el 23 de mayo de 2003 en la derrota 3 a 0 de local ante Unión de Santa Fé. Con tan sólo 20 años el arquero hacía sus primeros pasos en el club de sus amores. En esa temporada atajó sólo 7 partidos, sería a la siguiente que ganaría más minutos siendo titular indiscutido en la segunda mitad de 2004 y el primer semestre de 2005. En el Globo jugó un total de 62 partidos. Sus buenas actuaciones lo llevaron a Europa.
Europa
A mediados de 2005 el Palermo de Italia, en aquel entonces con equipo plagado de argentinos, contrató a Andujar. Fue a préstamo por 1 año a cambio de 600 mil euros. Según informó Transfermarkt.com. Tras 21 partidos en Italia y con muy buenas actuaciones, Estudiantes de La Plata le compró el pase al Globo, jugando así 3 temporadas exitosas en el Pincha de La Plata.
Con Sabella como DT ganaron la Copa Libertadores en 2009. Sus buenas actuaciones lo llevaron nuevamente a Europa. Catania pagó 3 millones de euros por la ficha, según informó el sitio web Eldia.com.ar. Su sueldo en aquel entonces era de 600 mil euros anuales.
En el conjunto italiano atajó 149 partidos siendo una de las grandes figuras del equipo. Fue entre 2009 y 2014 año en que fue parte del plantel subcampeón del mundo con Argentina en Brasil 2014. A fin de esa temporada lo compra el Napoli en 2 millones de euros. En la ciudad de Maradona atajó sólo 27 encuentros en 2 temporadas. Estudiantes vuelve a comprarlo en 450 mil euros, transformándose en capitán y máximo referente del plantel hasta la actualidad.
Selección Argentina
En la Selección de Argentina fue parte de la delegación en 2 mundiales, Sudáfrica 2010 y Brasil 2014. No sumó minutos allí, pero sí en amistosos y eliminatorias. Su primera convocatoria fue el 11 de noviembre de 2007 por eliminatorias. Su debut fue 2 años después previo al Mundial de Sudáfrica 2010. También estuvo en 3 Copas Américas, 2011, 2015 y 2016, siendo subcampeón en las 2 últimas.
Actualidad
Luego de una extensa y exitosa trayectoria el arquero jugará su último partido profesional. Será por la final de la Copa Argentina entre Estudiantes de La Plata, su histórico club, contra Defensa y Justicia. En total en el Pincha atajó 457 partidos, es el tercero con más presencias en la historia del club, detrás de Pelegrina y Herrera, según informó el portal Elgrafico.com.ar. Si bien no trascendió el monto oficial de su sueldo en Estudiantes, es uno de los jugadores que más gana junto a Guido Carrillo.